蛋白交联剂是一类小分子化合物，具有2个或者更多的针对特殊基团（-NH2、-COOH、-HS等）的反应性末端，可以和2个或者更多的分子分别偶联，从而使这些分子结合在一起。70年代时人们普遍使用戊二醛作为蛋白质交联剂连接抗体和指示剂（如酶类），但其缺点是由于交联基团是随机的，容易形成杂乱的多聚体。80年代，更具选择特异性的交联剂,例如NHS（针对-COOH）和马来酰亚胺（针对-HS)在生命科学研究中得到了更为广泛的应用。巧妙地运用交联剂可以在蛋白质相互作用研究，免疫学，癌症治疗等领域取得意想之外的收获。截至2010年，市面常用的蛋白质交联剂大约有一百多种。 　　蛋白交联剂的操作流程:首先将待交联的蛋白质A与交联剂在一定条件下反应，得到的蛋白质A-交联剂中间体，然后移除多余的交联剂，再加入欲交联的蛋白质B。产物中可能会形成多聚体，这一副产物通过调节反应条件来控制。分成两部反应的目的在于减少分子内交联以及形成蛋白质多聚物。另外，选择异源交联剂也可以减少多聚物的产生。 　　大多数蛋白质-蛋白质结合相互作用是瞬时的，通过交联方法可以稳定或永九连接相互作用复合物中的成分，从而有助于鉴别这些瞬时接触。一旦相互作用的成分被共价偶联，可以使用其他步骤（例如细胞裂解，亲和纯化和电泳）来制备分析样品，同时可维持初的相互作用复合物。