Cy3/Cy3.5/Cy5 NHS ester 染料活体成像应用（图）
 
 
菁染料是近红外荧光染料中常用的一类荧光染料，有显著的优势。由于细胞和组织的自发荧光在近红外波段小，因此在检测复杂生物系统时，近红外染料能提供更高的特异性和灵敏度。同时，由于光波在近红外区段的组织透过性更好。
 
产品说明：
菁染料是性能优良的荧光标记染料，摩尔吸光系数在荧光染料中是非常高的，其琥珀酰亚胺酯是常用的脂肪氨基标记试剂，广泛用于蛋白、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度，可改变其荧光发射波长，每增加一个双键，按照Huoffman 规则正好红移约100nm。
磺酸化菁染料和非磺酸化菁荧光染料可以用于标记各种不同的目标分子：
l        可在有机溶剂中溶解的蛋白质
l        抗体 (use 5-10% ofDMSO/DMF)
l        DNA和寡核苷酸
l        多肽
l        其他小分子，包括药用小分子及抑制剂
 
磺酸化菁荧光染料可用于：
Ø        在DMF或DMSO中变性的敏感蛋白
Ø        被透析及纯化的蛋白
Ø        水溶性的纳米粒子
Ø        不溶或疏水的蛋白
 
非磺酸化菁荧光染料可用于：
Ø        在有机介质反应（二氯甲烷、乙腈）
 
 
 
 
产品一 Cy3 NHSester （CY3,SE）
 
Cyanine 是一种属于聚甲炔基的合成染料,仍用于工业以增加感光乳剂的感光范围(例如增加
波长范围且使薄膜全色),最近用于生物技术领域.作为荧光染料,Cyanine 已用于生物医学成
像.根据它们的结构,cyanines 能覆盖 UV 到 IR 的光谱范围.
Cyanine3 NHS ester 可用作反应性染料,用于标记生物分子中的氨基。该试剂通常用于标记可溶性蛋白\多肽\寡核苷酸或 DNA. Cy3 NHS ester 需要使用有机
共溶剂(例如 DMF 或 DMSO)用于标记,然而,考虑到水溶性sulfo-Cyanine3 NHS ester 在精细蛋白中的使用,此类共溶剂不是必需的.Cy3荧光位于橙色区域(~550nm 激发, ~570 nm 发射),而Cy5 是在红色区域发光(~650/670nm),且在橙色区域吸收(~649nm).Cy3 可以通过配有标准的TRITC滤波器的荧光计\成像仪及显微镜检测.由于其固有的高消光系数,甚至肉眼也可以很容易地检测到凝胶和溶液中的 Cy3.
 
产品名称

Cy3 NHS ester
英文名称

(2E)-1-[6-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-2-[(E)-3-(1,3,3-trimethyl-5-sulfonatoindol-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]indole-5-sulfonate
Canonical SMILES

CC1(C2=C(C=CC(=C2)S(=O)(=O)[O-])[N+](=C1C=CC=C3C(C4=C(N3CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O)C=CC(=C4)S(=O)(=O)[O-])(C)C)C)C
分子式

C34H38N3NaO10S2

分子量

735.80
溶解度

very high in water, good in polar organic solvents (DMF, DMSO)

储存条件

在- 20°C的黑暗环境中保存24个月。运输：室温下长达3周。避免长时间暴露在光线下。干燥剂。
更高要求

为了获得更高的溶解度，请将管在37℃加热并在超声波浴中摇晃一段时间，原液可储存在20℃以下几个月。
Spectral properties
光谱信息
最大激发波长 (nm)

584

最大发射波长 (nm)

563
在最大激发波长下的消光系数, Lmol-1cm-1

162000

荧光量子产率

0.1
CF260

0.03

CF280

0.06
 
 
 
产品二 Cy3.5 NHSester （CY3.5,SE）
 
Cy3.5 NHS ester是一种活性染料，用于标记生物分子中的氨基，Cy3.5®NHS酯的类似物。该试剂是用于标记可溶性蛋白、肽和寡核苷酸/ DNA的理想试剂。溶解于有机溶剂DMSO，对于微妙的蛋白质考虑使用水溶性CY3.5-NHS酯，不需要使用任何共溶剂。
 
 
化学名称

Cy3.5 NHS ester
英文名称

2-((1E,3E)-3-(3-butyl-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)prop-1-en-1-yl)-3-(6-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-3-ium
Canonical SMILES

CC1(C)C2=C3C(C=CC=C3)=CC=C2[N+](CCCCCC(ON4C(CCC4=O)=O)=O)=C1/C=C/C=C5C(C)(C)C6=C(C=CC=C7)C7=CC=C6N\5CCCC
分子式

C42H44ClN3O4

分子量

690.27
溶解度

>69.6mg/mL in DMSO

储存条件

在- 20°C的黑暗环境中保存24个月。运输：室温下长达3周。避免长时间暴露在光线下。干燥剂。
更高要求

为了获得更高的溶解度，请将管在37℃加热并在超声波浴中摇晃一段时间，原液可储存在20℃以下几个月。
光谱信息
最大激发波长 (nm)

591

最大发射波长 (nm)

604
在最大激发波长下的消光系数, Lmol-1cm-1

116000

荧光量子产率

0.35
CF260

0.29

CF280

0.22
 
 
产品三 Cy5 NHSester （CY5,SE）
 
在过去的几年中，cy5已经成为生命科学研究和诊断领域的一个非常受欢迎的标签。荧光团在红色区域发射最大，其中许多CCD探测器表现出最大的灵敏度，荧光明亮。
 
 
Cy5 NHS ester 是用于标记肽、蛋白质和核苷酸中的氨基的活性染料。这种染料需要少量的有机共溶剂（如DMF或DMSO）用于标记反应。该试剂是非常可贵的有效标记的可溶性蛋白以及各种肽和核苷酸的理想试剂。该试剂也适用于小分子标记的有机溶剂。对于更复杂的目标，如易降解的蛋白质，当使用DMF或DMSO是不可取的，考虑使用水溶性Cy5 NHS ester，它不需要任何共溶剂，并且具有非常相似的荧光性质。
 
化学名称

CY5 NHS
英文名称

(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[(2E)-3,3-dimethyl-2-[(2E,4E)-5-(1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dienylidene]indol-1-yl]hexanoate
CAS:

1032678-42-4
Canonical SMILES

CC1(C2=CC=CC=C2[N+](=C1C=CC=CC=C3C(C4=CC=CC=C4N3CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O)(C)C)C)C
分子式

C36H42ClN3O4

分子量

616.19
溶解度

>31.5mg/mL in DMSO

储存条件

在- 20°C的黑暗环境中保存24个月。运输：室温下长达3周。避免长时间暴露在光线下。干燥剂。.
更高要求

为了获得更高的溶解度，请将管在37℃加热并在超声波浴中摇晃一段时间，原液可储存在20℃以下几个月。
光谱信息
最大激发波长 (nm)

646

最大发射波长 (nm)

662
在最大激发波长下的消光系数, Lmol-1cm-1

250000

荧光量子产率

0.2
CF260

0.03

CF280

0.04
 
 
  
菁染料Cy3 和Cy5 已成为基因芯片的首选荧光标记物; 另外,Cy5, Cy5.5 和Cy7 的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料。特别适合于活体小动物体内成像代替放射性元素。下图是CY5荧光标记小鼠的图片。
 
 
 
 
西安瑞禧生物科技有限公司可以提供种类最为齐全的CY系列染料，从CY3/CY3.5/CY5/CY5.5/CY7/CY7.5的末端各种活性基团包括COOH,  NH2, NHS,  MAL,  N3, ALK,  hydrazide,  SH等等不同活性基团。
N-羟基琥珀酰亚胺脂Dye NHS esters
Pyrenebutyric acid NHS ester
ROX NHS ester, pure 6- isomer
BDP FL NHS ester
FAM NHS ester
Cyanine3 NHS ester
Cyanine3.5 NHS ester
Cyanine5 NHS ester
Cyanine5.5 NHS ester
Cyanine7 NHS ester
Cyanine7.5 NHS ester
Sulfo-Cyanine3 NHS ester
Sulfo-Cyanine5 NHS ester
sulfo-Cyanine5 bis-NHS ester
Sulfo-Cyanine7 NHS ester
马来酰亚胺 Dye maleimides
Pyrene maleimide
BDP FL maleimide
Cyanine3 maleimide
Cyanine5 maleimide
Cyanine5.5 maleimide
Cyanine7 maleimide
Cyanine7.5 maleimide
Sulfo-Cyanine3 maleimide
Sulfo-Cyanine5 maleimide
伯胺 Primary amine
BDP FL amine
Cyanine3 amine
Cyanine5 amine
Cyanine5.5 amine
Cyanine7 amine
Cyanine7.5 amine
Sulfo-Cyanine5 amine
Sulfo-Cyanine7 amine
酰肼 Dye hydrazides
Pyrene hydrazide
BDP FL hydrazide
Cyanine3 hydrazide
Cyanine5 Boc-hydrazide
Cyanine5 hydrazide
Cyanine5.5 hydrazide
Cyanine7 hydrazide
Cyanine7.5 hydrazide
马来酰亚胺 Dye maleimides
BDP FL maleimide
Cyanine3 maleimide
Cyanine5 maleimide
Cyanine5.5 maleimide
Cyanine7 maleimide
Cyanine7.5 maleimide
Sulfo-Cyanine3 maleimide